Jeenbekov làm nghề chăn nuôi gia súc, và cũng tham gia chính trị. Ông trở thành Phó Đại hội đại biểu nhân dân năm 1995. Năm 2007, ông trở thành Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp, Thủy lợi và Công nghiệp Chế biến. Năm 2010, ông làm Thống đốc của khu vực Osh, và năm 2015, ông được bổ nhiệm làm Giám đốc Vụ Cán bộ Nhà nước. Tháng 3 năm 2016, ông được bổ nhiệm làm Phó chủ nhiệm thứ nhất của Văn phòng Tổng thống, trước khi được bổ nhiệm làm Thủ tướng Kyrgyzstan.[3]

Jeenbekov từ chức của Thủ tướng vào ngày 21 tháng 8 năm 2017, sau khi được chọn là ứng cử viên chính thức trong cuộc bầu cử tổng thống sắp tới. Ông tuyên bố rằng ông "muốn [ở] vị trí bình đẳng với các ứng cử viên tổng thống khác".